בבית הספר פועלת תוכנית ייחודית ללימודי ימאות בכיתות ח’ – יא’. במהלך לימודים אלה מקבלים התלמידים רישיון להשטת סירה מהירה. במסגרת השכלה כללית, נבנתה תוכנית ללימודי ימאות, אקולוגיה ושימור החוף לתלמידי כיתה י’. הלימודים משלבים תיאוריה ולימודים מעשיים ויחודיים בכך שהם מתקיימים על שפת הים. התוכנית היא יוזמה של בית הספר ונבנתה בשיתוף המרכז לחינוך ימי אשקלון.
